下载.puz文件数据库

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7.进入SRA数据库，点击Data access. 8.进入数据下载页面，下载fastq格式原始测序数据. 9.BAM数据下载. 有时候10x fastq不会被上传到数据库，相反客户会上传bam文件（除了FASTQ文件以外，SRA鼓励提交10x BAM文件），bam是Cell Ranger生成的输出文件之一。 Gencode数据库 1. 可以看出，GENCODE其实提供了protein-coding gene, small/long ncRNA gene, 假基因等的位置注释。有的gtf文件可以直接下载到（见图1，比如lncRNA gtf），有的没有单独给gtf文件，而是将信息包含在主gtf中的第9列（比如miRNA 保留文件原有的名称，在下载的时候可以指定新的文件名，也可以用原先的文件名。可以指定只能上传特定格式的文件，例如word文档、压缩包、excel表格等。思路. 注意：数据库只存放文件的描述信息（例如文件名、所在路径），不存文件本身。上传流程： [SEER01]-SEER数据库介绍与数据下载 SEER数据库介绍. 基本介绍：SEER数据库全名(Surveillance, Epidemiology, and End Results)，是美国权威的癌症统计数据库，该数据库记录了美国部分州县上百万名恶性肿瘤患者的发病率、死亡率和患病情况等信息。 SEER数据库旨在降低美国人口的癌症负担，数据库中肿瘤信息通过 5、输入显示所有数据库命令：show databases; 一定要有分号，并按回车. 6、显示系统默认的4个数据库 . 四、NavicatforMySQL下载及使用 . 1、下载后的文件名称为：NavicatforMySQL.zip，示意图如下： 2、解压到D盘，示意图如下： 3、执行文件示意图： 4、双击后显示主界面选择Genome子数据库，同样在搜索框输入物种英文名或拉丁学名，例如，输入human，我们查找人的基因组数据，如下所示：前面我们讲到了在NCBI数据库中下载物种基因组注释GFF文件，其实我们还可以… 查看snapshotDate()函数，发现它属于AnnotationHub 包，再次查看相关函数，发现了它存放数据库文件的地址，如下：可以看到，其函数下载的数据库文件，都在这里，其实找一下8月30号的文件即可，但是我嫌弃它麻烦，就全部打包啦。上传到百度云：

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